Park leży na terenie województwa małopolskiego. Położony jest w całości na obszarze Płaskowyżu Ojcowskiego, a dominującym elementem krajobrazu Parku są doliny głęboko wcięte w wapienne, skalne podłoże. Skałki zboczowe dolinek-jarów, przybierają różnorodne kształty ostróg, iglic, organów, ambon.

Znajdują się tu także liczne jaskinie, w tym największa na Jurze (ponad 900 m długości), udostępniona turystycznie Jaskinia Wierzchowska Górna. Lasy Parku to głównie fragmenty Puszczy Trzebińsko-Olkuskiej. Najciekawsze zbiorowiska leśne to buczyny karpackie i lasy grądowe, a ze zbiorowisk nieleśnych naskalne murawy kserotermiczne i wrzosowiska.