Powstanie kościoła i klasztoru jest ściśle związane z historią miasta Alwerni. Nazwa Alwernia odnosiła się pierwotnie do klasztoru bernardynów, zbudowanego na lesistym wzgórzu Podskale. Budowę podjeto z inicjatywy właściciela - Krzysztofa z Korytna Korycińskiego ( herbu topór), który będac dyplomatą podróżował po wielu krajach. W czasie jedniej z podróży zwiedził Włochy i zachwycił się malowniczym położeniem pustelni Alverano nad rzeką Arno w Toskani. Na jej wzór postanowił ufundować kościół i klasztor bernardynów, których w niedługim czasie sprowadził z Krakowa.

W kościele szczególnie cenne są barokowe, drewniane figurki, oraz figurki woskowe w szatach z tkanin. Obecnie kościół stanowi sankturaium Jezusa Miłosiernego.

Główne uroczystości: 2-ga niedziela Wielkanocy oraz 17 września